Для анализа органических примесей в воде используются хроматографические методы, позволяющие проводить с высокой чувствительностью и селективностью идентификацию и количественное определение многих соединений в большом диапазоне концентраций на фоне сложных матриц переменного состава.
Для анализа следовых количеств летучих и полулетучих органических соединений наиболее информативным и надежным методом анализа является хромато-масс-спектрометрия. При анализе летучих соединений применяется концентрирование на сорбенте с последующей десорбцией (метод Purge&Trap).